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I ricercatori di Google e del Janelia Research Campus dell'Howard Hughes Medical Institute hanno creato una sofisticata rappresentazione neurale 3D del cervello di un moscerino della frutta. La mappa 3D si chiama connettoma e contiene circa 25.000 neuroni insieme a circa 20 milioni di sinapsi.
I ricercatori affermano che il loro lavoro è il il più grande connettoma a livello sinaptico creato finora. Il processo ha coinvolto l'imaging, la ricostruzione e la correzione di bozze del modello 3D per l'accuratezza.
Il tessuto cerebrale della mosca è stato diviso in lastre separate dello spessore di 20 micron. Le lastre sono state sottoposte a imaging con una risoluzione voxel di 8x8x8nm3 utilizzando microscopi elettronici a scansione a fascio ionico focalizzato.
Il team di Google ha ricostruito l'intero emibranio utilizzando una tecnica chiamata reti di riempimento delle inondazioni (FFN). "Gli FFN sono stati la prima tecnologia di segmentazione automatizzata a produrre ricostruzioni sufficientemente accurate da consentire il proseguimento dell'intero progetto emibranico".
Utilizzando gli FFN, Google è riuscita a ridurre il tempo necessario per la correzione delle bozze rispetto ai correttori umani. Il blog di Google rileva che la correzione di bozze umana avrebbe richiesto decine di milioni di ore mentre FFN la raggiunge in centinaia di migliaia di ore umane.
Il team ha impiegato due anni per correggere le proprie scoperte anche con l'aiuto di FFN, il che significa la complessità. "Abbiamo applicato numerosi algoritmi di apprendimento automatico e oltre 50 anni-persona di lavoro di correzione di bozze in 2 anni solari per estrarre una varietà di rappresentazioni più compatte e utili, come scheletri di neuroni, posizioni di sinapsi e grafici di connettività"., hanno scritto i ricercatori nel documento.
Il progetto si sforza di essere una risorsa pubblica per gli scienziati. Il team di ricerca ha anche rilasciato alcuni strumenti che puoi utilizzare per la visualizzazione e l'analisi. Puoi saperne di più sul progetto nel documento di ricerca e sfogliare i dati qui.
